בעקבות הפעילות המודיעינית של שב”כ, שבוצעה לאחר הפיגוע, נעצרו לחקירה מבצעיו וכ-30 פעילים נוספים, המעורבים בפעילות התשתית.
בחקירת העצורים, בשירות הביטחון הכללי, נחשף מידע רב על פעילותה של התשתית. בין היתר, עלה כי חלק מהפעילים גויסו לפעילות בירדן, כבר בשנת 2012.
הם עברו הכשרות צבאיות וקיבלו משימות, ומתחילת 2014 החלו להיכנס לשטח, כדי לקדם את הפעילות. בין משימותיהם: קיום מפגשים עם פעילים, הכנת תשתיות, ואיסוף מודיעין על יעדים לפיגוע.
על-פי הנחקרים, היעדים לפיגוע היו:
פיגועי ירי ומטענים כנגד יעדים ישראליים באיו”ש (צירי תנועה, יישובים, נקודות צבא).
פיגועי חדירה ליישובים ישראליים.
פיגועי חטיפה של ישראלים באיו”ש ובחו”ל.
פיגועי מכונית תופת.
גיוס חוליות צבאיות בירדן לטובת מימוש פיגועי חדירה לתחומי ישראל.
פיגוע באצטדיון “טדי” בירושלים.
פיגוע כנגד הרכבת הקלה בירושלים.
פרטים על המחבלים המרכזיים של התשתית שנעצרו:
מנאף מוחמד עבד אלרחמן אג’בארה, בן 28, תושב ירדן. גויס לפעילות חמאס בהיותו סטודנט ללימודי הנדסה. מסר בחקירתו כי עבר הכשרות צבאיות, וקיבל משימות מבכירי הארגון לבסס השתקעות באיו”ש, לגייס פעילים לפעילות צבאית, ולממש פיגועים כנגד יעדים ישראליים (יישובים ועמדות צבא). בנוסף, הודה אג’בארה כי סייע בהכנת מנגנון ההפעלה למטען, בו נעשה שימוש בפיגוע, שבוצע ב-31 אוגוסט בצומת ג’ית ובצומת רחלים.
רג’אאי אחמד מצטפא עמורי, בן 30, תושב טול כרם. פעיל חמאס צבאי, כלוא לשעבר 5 פעמים, בגין פעילות חמאס צבאית. גויס לפעילות הנוכחית בתחילת שנת 2014 על ידי עלי סעיד אחמד סעיד, פעיל חמאס צבאי מרצועת עזה. הודה, כי יחד עם מחמד סלימאן, שהגיע מירדן הכינו את המטענים, ששימשו לפיגועים בצומת ג’ית ובצומת רחלים וכן בתכנון פיגוע מכונית תופת. בנוסף, הודה בביצוע הפיגוע בפועל.
מחמוד ואאל מחמוד מלחם, בן 30 , תושב ענבתא/טול כרם, פעיל חמאס צבאי, כלוא לשעבר בגין פעילות חמאס צבאית בהנחיית נציגי חמאס בירדן. נעצר במסגרת הפרשייה על-רקע היותו סייענו של רג’אאי עמורי. הודה כי שכר דירת מסתור ברמאללה, בה הוסתרו אמצעי לחימה וחומרים לייצור מטענים. הסגיר רובה מסוג M16, תחמושת וחומרים לייצור מטענים, שהוסתרו על ידו לבקשתו של רג’אאי עומרי.
עבדאללה מחמד יוסף זיתאוי, בן 25, תושב ירדן. הודה כי בשנים 2013-2012 עבר ברצועת עזה 3 אימונים צבאיים, שהתמקדו בתחומי החבלה והירי. בתחילת שנת 2014 הונחה על ידי נציג מפקדת החמאס בירדן להיכנס לאיו”ש ולבסס את חייו שם בהמתנה למשימות שיקבל בהמשך.
מוצעב ח’אלד אבראהים דויב, בן 23, תושב זעתרה/בית לחם. שהה בירדן בלימודים בין השנים 2014-2010. הודה כי קיבל מפעיל חמאס בירדן משימה לסייע בפעילות באיו”ש, וכי התבקש, טרם חזרתו לכפרו, לסייע בהעברת אמל”ח וכספים למנאף אג’בארה, לטובת קידום פעילות בה משולב מנאף.
עדנאן תיסיר כאמל סמארה, בן 30, תושב ספארין/טול כרם. פעיל חמאס צבאי, כלוא לשעבר 4 פעמים, בשל פעילות חמאס צבאית. בחקירתו הודה בסיוע למנאף אג’בארה במסגרת פעילותו הצבאית של האחרון, וכי קיבל לידיו רובה, ותכנן לגייס חוליה צבאית לצורך ביצוע פיגועים.
צוהיב רדואן מחמד תאבת, בן 29, תושב בית דגן/בקעות, בן למשפחת פעילי חמאס. הודה בחקירתו כי בעת שהייתו גויס לפעילות חמאס צבאית. נפגש שם עם מספר פעילי חמאס, אשר העבירו לו הכשרות בתחומים של התנהלות חשאית, נשק וחבלה. אמור היה לחזור להמשך האימונים בירדן באפריל ובינתיים הסכים לפעול, עם חזרתו לכפרו, לגיוס נוספים לפעילות בחוליית חמאס צבאית.
מחמד יוסף מחמד שורבג’י, בן 25, במוצאו מכווית, למד בירדן. נעצר באוקטובר, בעת כניסתו לאיו”ש. הודה בחקירתו כי גויס לפעילות חמאס צבאית במהלך אפריל 2014 על-ידי פעיל חמאס בירדן. קיבל הנחיות לסייע בהעברת מסרים מחו”ל לפעילים באיו”ש. היה מתוכנן להמשיך את הכשרתו הצבאית בירדן, אך נעצר, כאמור, בעת כניסתו לאיו”ש.